Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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