Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms