Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP290O15078 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP290O15078 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP290O15078 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP290O15078 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP290O15078 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP290O15078 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP290O15078 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP290O15078 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP290O15078 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP290O15078 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP290O15078 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP290O15078 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP290O15078 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP290O15078 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP290O15078 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP290O15078 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.62
CEP290O15078 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP290O15078 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP290O15078 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP290O15078 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP290O15078 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP290O15078 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP290O15078 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP290O15078 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP290O15078 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP290O15078 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP290O15078 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CEP290O15078 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms