Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms