Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm12A2AJ77 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm12A2AJ77 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms