Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd1Q9Z2E2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms