Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X0

Ccl27, C-C motif chemokine 27, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl27Q9Z1X0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl27Q9Z1X0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms