Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms