Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Cldn12Q9ET43 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Cldn12Q9ET43 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Cldn12Q9ET43 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Cldn12Q9ET43 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Cldn12Q9ET43 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cldn12Q9ET43 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cldn12Q9ET43 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cldn12Q9ET43 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cldn12Q9ET43 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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