Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Cldn19Q9ET38 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Cldn19Q9ET38 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Cldn19Q9ET38 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Cldn19Q9ET38 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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