Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SyncQ9EPM5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms