Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Xrn2Q9DBR1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Xrn2Q9DBR1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Xrn2Q9DBR1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Xrn2Q9DBR1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrn2Q9DBR1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Xrn2Q9DBR1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Xrn2Q9DBR1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Xrn2Q9DBR1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Xrn2Q9DBR1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Xrn2Q9DBR1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Xrn2Q9DBR1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Xrn2Q9DBR1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Xrn2Q9DBR1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrn2Q9DBR1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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