Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA5

1700016D06Rik, RIKEN cDNA 1700016D06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700016D06RikQ9DAA5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms