Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Calr3Q9D9Q6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Calr3Q9D9Q6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Calr3Q9D9Q6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Calr3Q9D9Q6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Calr3Q9D9Q6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Calr3Q9D9Q6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Calr3Q9D9Q6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Calr3Q9D9Q6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms