Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms