Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Snx10Q9CWT3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Snx10Q9CWT3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx10Q9CWT3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Snx10Q9CWT3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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