Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms