Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms