Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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