Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQC3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQC3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQC3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQC3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms