Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmed9Q99KF1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
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