Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms