Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hps3Q91VB4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms