Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Usp27Q8CEG8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Usp27Q8CEG8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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Usp27Q8CEG8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Usp27Q8CEG8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Usp27Q8CEG8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp27Q8CEG8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp27Q8CEG8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp27Q8CEG8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
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Usp27Q8CEG8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms