Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9F4

Gm9949, Predicted gene 9949, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9949Q8C9F4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm9949Q8C9F4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm9949Q8C9F4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm9949Q8C9F4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm9949Q8C9F4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm9949Q8C9F4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm9949Q8C9F4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm9949Q8C9F4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9949Q8C9F4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm9949Q8C9F4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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