Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp4bQ8C6J9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp4bQ8C6J9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp4bQ8C6J9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp4bQ8C6J9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp4bQ8C6J9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp4bQ8C6J9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp4bQ8C6J9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp4bQ8C6J9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp4bQ8C6J9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Nlrp4bQ8C6J9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Nlrp4bQ8C6J9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp4bQ8C6J9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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