Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnphQ80U23 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnphQ80U23 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnphQ80U23 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnphQ80U23 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnphQ80U23 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnphQ80U23 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnphQ80U23 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnphQ80U23 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnphQ80U23 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnphQ80U23 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnphQ80U23 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnphQ80U23 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnphQ80U23 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnphQ80U23 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnphQ80U23 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SnphQ80U23 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnphQ80U23 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnphQ80U23 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnphQ80U23 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnphQ80U23 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnphQ80U23 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnphQ80U23 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnphQ80U23 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnphQ80U23 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnphQ80U23 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms