Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms