Protein–RNA interactions for Protein: Q78IQ7

Slc39a4, Zinc transporter ZIP4, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc39a4Q78IQ7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc39a4Q78IQ7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc39a4Q78IQ7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms