Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms