Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms