Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Utp18Q5SSI6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms