Protein–RNA interactions for Protein: Q56A07

Scn2b, Sodium channel subunit beta-2, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2bQ56A07 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Scn2bQ56A07 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Scn2bQ56A07 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Scn2bQ56A07 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Scn2bQ56A07 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Scn2bQ56A07 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Scn2bQ56A07 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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