Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms