Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3V0E1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3V0E1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3V0E1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3V0E1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3V0E1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3V0E1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms