Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms