Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lrrn4clQ3TYX2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms