Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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CALCOCO2Q13137 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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