Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms