Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sox9Q04887 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms