Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms