Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms