Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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