Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp5P56399 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms