Protein–RNA interactions for Protein: P51410

Rpl9, 60S ribosomal protein L9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl9P51410 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl9P51410 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl9P51410 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl9P51410 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl9P51410 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl9P51410 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl9P51410 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl9P51410 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl9P51410 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl9P51410 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl9P51410 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl9P51410 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl9P51410 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl9P51410 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl9P51410 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl9P51410 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl9P51410 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl9P51410 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl9P51410 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl9P51410 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl9P51410 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl9P51410 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl9P51410 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl9P51410 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl9P51410 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl9P51410 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl9P51410 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl9P51410 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms