Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Tmod1P49813 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Tmod1P49813 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Tmod1P49813 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Tmod1P49813 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Tmod1P49813 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Tmod1P49813 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Tmod1P49813 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Tmod1P49813 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Tmod1P49813 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Tmod1P49813 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Tmod1P49813 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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