Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig1P37913 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig1P37913 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig1P37913 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig1P37913 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms