Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf239P24399 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf239P24399 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf239P24399 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms