Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18528 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18528 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
P18528 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
P18528 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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P18528 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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P18528 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18528 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18528 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18528 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18528 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18528 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18528 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18528 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18528 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18528 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18528 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18528 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms