Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cxcl2P10889 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms